宋祁幼年与兄随父在外地读书，日子艰辛，稍长离父还乡，与兄宋庠于天圣二年（1024）参加科考。宋祁本是殿试时的状元，宋庠为探花，但章献太后刘娥不同意，谓弟不可以先兄，将宋庠定为状元，而置宋祁为第十名。世人称誉兄弟俩为“双状元”，分别称为“大宋”、“小宋”。
宋祁初任复州军事推官。经皇帝召试，授直史馆。历官龙图阁学士、史馆修撰、知制诰。曾上疏认为国用不足在于“三冗三费”，三冗即冗官、冗兵、冗僧，三费是道场斋醮、多建寺观、靡费公用，主张裁减官员，节省经费。并与欧阳修同修《唐书》，《新唐书》大部份为宋祁所作，前后长达十余年。书成，进工部尚书，拜翰林学士承旨。嘉祐六年卒，年六十四，谥景文。